木论自然保护区始建于1991年，1996年6月晋升为自治区级（省级）保护区，1998年8月，经国务院批准建立国家级自然保护区。总面积108.297平方公里。地理坐标：东经107°53′29″～108°05′42″，北纬25°06′09″～25°12′25″。包括川山镇的东山、下荣、乐依、木论、白丹、社村、何顿等七个行政村的部分喀斯特山地及木论村板南屯后山单性木兰保护小区。
木论林区属中亚热带石灰岩常绿落叶混交林森林生态系统，保存极为完好，覆盖率高达97.13%，是世界同纬度地区极罕见，并与贵州茂兰保护区共同构成世界上同纬度地区连片面积最大、保存最完好的喀斯特森林生态系统。林区内物种极丰富，据初步调查有维管束植物1446种，其中，属国家一级植物有单性木兰、掌叶木、红豆杉、单座巨苔等5种，二级保护植物有12种。初步调查统计有兰科植物(兰花)123种，被IUCN列为濒危物种的有麻栗坡兜兰、白花兜兰、硬叶兜兰等。陆生脊椎动物284种，其中，属国家一级保护有3种，二级保护有31种。已鉴定有昆虫408种。洞穴生物多样性也极其丰富，已探知有动物140种（其中真洞穴动物50余种，皆为木论或其邻近喀斯特地区的特有种），包括5新属和40余新种。国际洞穴生物专家认为木论及其邻近喀斯特地区是东南亚洞穴生物多样性最为丰富的地区。
保护区旅游资源丰富，景观价值高，有突出的喀斯特森林生态系统和喀斯特森林地貌景观、良好的古宾河漂流河段、浓郁的毛南族风情人文景观、历史悠久的黔桂古道。
木论保护区经过多年的发展，特别是GEF项目在保护区实施以后，各项基础设施建设得到不断完善，形成了“局—站——点”管理体系，建立了稳定的巡山护林队伍，社区共管取得明显成效，成为广西林业系统保护区基础设施较为齐全、管理方式比较先进的保护区之一。
木论国家级自然保护区经过艰苦奋斗，经历了从无到有、从小到大、从弱到强的发展历程，知名度逐步提高，成为中国人与生物圈网络保护区，是多个高等高等院校和科研机构的教学实习和科研基地，近年来，承担各级科研项目14项，公开发表科技论文53篇。2011年被评为“全区野生动植物保护与自然保护区管理先进集体”，2012年被评为自治区文明单位，2013年列入世界自然遗产名录，我们以此为契机，加强保护，提高能力建设，打造成一流的示范性自然保护区。