受今年第13号台风“康森”和第14号台风“灿都”影响，9月10日傍晚“实验6”综合科考船回到万山群岛附近海域锚地避风，经过了一天半的重新休整，9月12日上午9时再次出发，正式拉开本航次第二阶段的科考任务。
9月12日上午8时30分，“实验6”综合科考船船员收锚备航。上午9时整，“实验6”综合科考船再一次乘风出发，驶向深蓝。
航次首席科学家杜岩在接受记者独家采访时说：“昨天一整天的休整，我们把仪器和船上的设备都重新安排调整，对下一个阶段的航次任务，做了详细的安排。我们今后三天的任务将会回到暖涡的观测海区，观测台风后整个海洋状况。台风过程会引起整个海洋物理化学生态系统调整，这次是在南海‘双台风’条件下，首次迅速地对台风观测的一次科考。”
9月6日，中国科学院南海海洋研究所“实验6”综合科考船从广州首航，赴珠江口—南海北部海域执行多学科综合观测重要科学任务。（中央广播电视总台记者郑澍 陈杰雄）